Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms