Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nek9Q8K1R7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek9Q8K1R7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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