Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q8CF25 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q8CF25 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q8CF25 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q8CF25 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms