Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms