Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q8C708 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms