Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms