Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms