Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me3Q8BMF3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms