Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms