Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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Npm2Q80W85 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Npm2Q80W85 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Npm2Q80W85 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npm2Q80W85 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms