Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Pcsk9Q80W65 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pcsk9Q80W65 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pcsk9Q80W65 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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