Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ube2q1Q7TSS2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms