Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssh1Q76I79 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms