Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trpv1Q704Y3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv1Q704Y3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms