Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop58Q6DFW4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop58Q6DFW4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms