Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q6DFW0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q6DFW0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6DFW0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms