Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms