Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgd6Q69ZL1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms