Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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