Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ss18Q62280 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ss18Q62280 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ss18Q62280 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ss18Q62280 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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