Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift88Q61371 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms