Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mre11Q61216 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms