Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf123Q5XPI3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms