Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NacadQ5SWP3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacadQ5SWP3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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