Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psme4Q5SSW2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms