Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc27Q3V036 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms