Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp30Q3UN04 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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