Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms