Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms