Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U595 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q3U595 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms