Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms