Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna5Q2MKA5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms