Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VgfQ0VGU4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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VgfQ0VGU4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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VgfQ0VGU4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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VgfQ0VGU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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VgfQ0VGU4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VgfQ0VGU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms