Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp2b3Q0VF55 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms