Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Calb2Q08331 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Calb2Q08331 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Calb2Q08331 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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