Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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