Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Emx2Q04744 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Emx2Q04744 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Emx2Q04744 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Emx2Q04744 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms