Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms