Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms