Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms