Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LystP97412 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LystP97412 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LystP97412 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms