Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psme1P97371 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms