Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubg1P83887 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms