Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms