Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms