Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl23aP62751 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl23aP62751 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms