Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms