Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Irf5P56477 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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