Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rrp1P56183 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rrp1P56183 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms