Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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